שימור הקרקע בשטחים החקלאיים הינו נושא משמעותי מאוד בימינו ומשנה לשנה צובר תאוצה ומודעות בקרב החקלאיים והסביבה. ביצוע העבודות לשימור הקרקע נעשה בשיתוף פעולה מצוין של רשויות הניקוז עם משרד החקלאות ועם חקלאי האזור ומניב יוזמות חדשות מדי שנה המאפשרים ביצוע עבודות למזעור נזקי סחף קרקע וניקוז תת קרקעי של השטחים החקלאיים, דבר המאפשר עיבודים וגידולים חקלאיים בצורה הטובה ביותר.
בשטחים החקלאיים ישנן בעיות ניקוז הנגרמות ע"י זרימה של נגר עילי או מי תהום גבוהים הגורמים לחירוץ, סחף קרקע ולשיבוש דרכי הגישה החקלאיות לתוך השטחים החקלאיים.
על מנת להתגבר על בעיות הניקוז בשטחים, ישנם מס' פעולות ניקוז ודרכי ביצוע עיקריים בשימור קרקע המאפשרים ניקוז אופטימאלי של השטחים החקלאיים ומזעור של חירוץ וסחף הקרקע למורד השטח.
בשנים האחרונות רשות הניקוז השקיעה כספים רבים בפרויקטים של תכנון וביצוע בתחום שימור הקרקע בגליל העליון, עמק הירדן, הגליל התחתון, הגולן ובבקעת יבנאל.
בין הפרויקטים שבוצעו בשנים האחרונות נמנים:
שטחי חקלאות – ספסופה שטחי חקלאות – מושבה כינרת, שטחי חקלאות – מושב רמות, הסדרת תעלות ניקוז אזוריות דרום רמת הגולן שלב ה', הסדרת תעלות ניקוז אזוריות, הסדרת ניקוז דרכים חקלאיות עלמה, כחל, שעל, יראון, דישון, אלמגור ועוד.
