פעולות אלה נועדו לייעל את מערכות הניקוז בעתיד בכדי להבטיח תפקוד טוב יותר בחורף הבא. תחזוקה זו מתמקדת בעיקר בעבודות לשיפור תשתיות ניקוז הקיימות. למשל, התקנה והוספה של מעבירי מים, מעבירים איריים בחציית תעלות ונחלים, הסדרת דרכי תחזוקה לאורך נחלים ותעלות ניקוז, העמקה והרחבה של עורקי הניקוז לצורך התמודדות בהגדלת ספיקות התכן כתוצאה מגידול בבינוי ובפיתוח סביבתי.
ישנה חשיבות רבה לעבודת התחזוקה השנתית וההיערכות לקראת תחילת החורף הקרב במזעור נזקי הזרימות בחורף בהצפות ושיטפונות של האזור