תחזוקה זו מתבצעת על פי הערכת מצב בתום החורף. מטרתה לשקם מערכות ניקוז שניזוקו עקב הזרימות המוגברות במהלך החורף ולהחזיר אותם לתפקוד מלא לקראת השטפונות הבאים. העבודה כוללת שיקום והחלפת מעבירי מים, הסדרת גדות נחלים ותעלות ניקוז שנפגעו וקרסו באמצעות דיפון באבן בולדר, מילוי וכיסוי של קרקע שנחרצה ועוד.
