שלב ג' בשיקום מורד הירדן מהתחברות הנחל לאגם מנחמיה וצפונה כולל פעולות ניקיון יסודיות והחלפת קרקע לצורך זירוז תהליך שיקומו בעקבות עשרות שנים של הזרמת שפכים לאפיק הירדן.
עם השלמת שלב ב' בשיקום מורד הירדן במבואה הדרומית וכן המקטע שבין דגניה לבית זרע, ממשיך במרץ אגף ניקוז ונחלים ברשות הכינרת בעבודה האינטנסיבית לשלב ג' של הפרוייקט, שיקום מקטע באורך 1.2 ק"מ מהתחברות הנחל לאגם מנחמיה וצפונה.
עלות עבודות שיקום המקטע 4.2 מיליון ש"ח ובמימון הקרן לשטחים פתוחים, רשות הכינרת, רשות הטבע והגנים, והמשרד להגנת הסביבה.
עקב הזרמת שפכים לאפיק הירדן במשך עשרות שנים, יבוצעו פעולות ניקיון יסודיות באפיק, על מנת לזרז את תהליך השיקום וכן פעולות להחלפת קרקע. מדובר בפעולה מורכבת ויקרה במיוחד בשל הקושי להוציא מהקרקעית משקעים וסחף שהצטברו במהלך השנים.
העבודות מתבצעות תוך תכנון מוקפד ופעולות אינטנסיביות באמצעות כלים הנדסיים כבדים ומשאבים רבים.